Фолдінг білків перетворили на комп'ютерну гру

Приголомшливу гру розробили вчені з Вашингтонського університету (США). Програма під назвою Fold.it являє собою модель згортання білків у тривимірні конструкції. Геймер повинен спробувати зробити це найбільш вдалим чином. У програму будуть завантажуватися реальні дані про справжніх, тільки що винайдених протеїнах, які незрозуміло як згортаються. Результати відправляться через інтернет в центр обробки, де їх перевірять на суперкомп'ютері (це буде з осені, а поки що в програму закладені вже вирішені загадки, так що зараз вона виконує роль тренажера).

Насправді, всі геймери нашого світу витрачають мільярди людино-годин на марні для людства ігри типу WoW, Counter-Strike або пасьянсу «Косинка». Водночас вони могли б використовувати інтелект більш ефективно: наприклад, згортання білок на екрані свого монітора. Адже це теж по-своєму цікаво.

Один з розробників гри, професор біохімії Девід Бейкер, щиро вірить, що десь у світі живуть таланти, у яких є вродженість прораховувати в розумі 3D-моделі протеїнів. Якийсь 12-річний хлопчик з Індонезії побачить гру і зможе вирішити завдання, які не під силу навіть суперкомп'ютеру. Хто знає, може, такі люди дійсно є?

Кожен протеїн (у людському тілі їх понад 100 000 видів) являє собою довгу молекулу. Передбачити, в яку хитромудру форму згорнеться ця молекула в тих чи інших умовах (і чи здатна вона взагалі згорнутися в яку-небудь стійку форму) - завдання вищого ступеня складності. Комп'ютерне моделювання - це ресурсоємний процес, але в той же час критично важливий у фармацевтиці. Адже не знаючи форми білка неможливо змоделювати його властивості. Якщо ж ці властивості є корисними, то протеїни можна синтезувати і на їх базі зробити нові ефективні препарати, наприклад, для лікування раку або СНІДу (Нобелівська премія гарантована в обох випадках).

Зараз над обраховуванням моделі кожної нової молекули білка працюють сотні тисяч комп'ютерів у розподіленій обчислювальній мережі, проте вчені з Вашингтонського університету пропонують інший спосіб: не тупий перебір всіх варіантів, а інтелектуальний мозковий штурм через комп'ютерну гру. Кількість варіантів скорочується на порядок, а суперкомп'ютер набагато швидше знайде правильні параметри фолдингу.

У тривимірну «розважалку» Fold.it можуть грати всі: навіть діти і секретарки, які поняття не мають про молекулярну біологію. Розробники постаралися зробити таку гру, щоб вона була цікава кожному. А результат гри цілком може стати основою для Нобелівської премії і врятувати життя тисяч людей.

Програма випущена у версіях під Win і Mac. Дистрибутив розміром 53 МБ можна завантажити після реєстрації.